悪魔の赤ちゃんの父親のひとりであるステファン(マイケル・モリア-ティー)が法廷で赤ちゃんの処刑は不当だと訴え、赤ちゃん達を隔離された無人島に移すという判決を勝ち取る。5年後、ステファンを含む調査隊が島を訪れるが、成長した赤ちゃん達はステファン以外の隊員を惨殺して船を奪い、本土へと向かう。彼らの目的とは…?