空に謎の三日月型の島を見つけたのび太は「あれこそ僕が探していたユートピアだ!」と言い張り、ドラえもんたちと一緒にひみつ道具の飛行船『タイムツェッペリン』で、その島を探しに出かけることに! 色々な時代･場所を探してやっと見つけたその正体は、誰もがパーフェクトになれる夢のような楽園〈パラダピア〉だった! そしてそこで出会ったのは、何もかも完璧なパーフェクトネコ型ロボット･ソーニャ。すっかり仲良くなったドラえもんたちとソーニャだったが、どうやらこの楽園には大きな秘密が隠されているようで…。はたしてのび太たちは、その楽園の謎を解き明かすことができるのか!?