いたずらが大好きなひつじのショーンは、おとぼけな牧場主、気立てのいい牧羊犬のビッツァー、そしてひつじの仲間たちと幸せに暮らしていた。ある日、ショーンたちの些細ないたずらがきっかけで牧場主の居場所がわからなくなってしまい、みんなで街へ探しに行くことに。果たしてショーンと仲間たちは危険がいっぱいな大都会で牧場主を見つけ出し、牧場に帰ることができるのか？