ロボットアニメ史上に新たな金字塔を打ち立てた「機動戦士ガンダム」の劇場用3部作第1弾。TV版の第1〜13話を再編集し、アムロがガンダムを起動してから巨大な敵の姿を認識するまでを収録している。宇宙世紀0079、ジオン公国軍のシャア・アズナブル率いる部隊が、連邦軍が密かに開発中のモビルスーツ・ガンダムを狙い、スペースコロニー・サイド7に侵入。サイド7で暮らしていた少年アムロ・レイは、ガンダムを起動させてジオンのモビルスーツと戦い、これを撃破。サイド7の人々と共に連邦軍の新型戦艦ホワイトベースに逃げ込んだアムロは、ガンダムのパイロットとして戦争の渦中に巻き込まれていく。