三船敏郎演ずる剣聖・宮本武蔵が、生涯の宿敵である佐々木小次郎と巌流島にて対決するまでの物語を描いた三部作完結編。江戸に出た武蔵と小次郎。しかし、官僚的栄達に絶望した武蔵は再び旅に出て、畑を耕す生活を始める。それを聞きつけて、追い慕う朱美とお通だったが、2人を思わぬ悲劇が襲う。そんな中、小次郎から果たし状が届く武蔵。決闘の場所は巌流島。無念無想の境地で、単身舟をすすめる武蔵はどうなるか・・・。