科学特捜隊のハヤタ隊員は、謎の青い球体を追跡中に、竜ヶ森の上空で赤い球体と衝突して墜落。その球体の中には、M78星雲から来た宇宙人・ウルトラマンがいた。ハヤタに瀕死の重傷を負わせてしまったウルトラマンは、彼と命を共有し、地球を守ることを誓う。