アルバート・ジョーンズ

ニールの宿敵で服役中のケラーがFBIに取引きを持ちかけてきたため、ニールとピーターが刑務所へ向かう。ケラーは、別の刑務所への移送が決まっているが、その中止と引き換えに、悪質なパスポート偽造者ラングの情報を教えるという。調べると、ラングはケラーの元相棒で、現在は写真家になっていた。翌朝、出勤前にエリザベスと些細なことから夫婦ゲンカをして、ピーターは気がかりだったが、ラングのもとをニールともに訪ねる。

ある富裕な慈善事業家が、誰かが故意に自分に致命的疾患を負わせたと主張し、ホームズにその犯人探しを引き受けてくれるよう懇願する。その一方、ホームズはワトソンに探偵業のコツを示そうとあれこれ指導する。

フリンジ･チームと密接な関係を持つ人物が突然襲われた。さらに、テロリストのジョーンズが再び現われ、ビショップ博士は不可解な失踪を遂げる･･･。これまでのさまざまな疑問に答えが見つかり、検証され、個々の絆が試されるときが来た。オリビア、ピーター、ビショップ博士を取り巻く謎の事件の詳細も明らかになっていく。そして、ついに謎の人物、ウィリアム･ベルが姿を現す。

ダニーの同僚の刑事が麻薬密売の潜入捜査中に殺される。ダニーは犯人を捜そうと躍起になり…。

ブルは父親になる準備を進める一方、仕事では優秀な社内弁護士ベニーを失い行き詰まっていた。ブルが元妻でありベニーの姉でもあるイザベラ (ヤラ･マルティネス) と再び深い関係を持ったことから、ベニーは怒ってTACを去ったのだ。そんな折、過失致死罪で起訴された若いバーテンダーの弁護を引き受けたTACチームは、法廷で苦戦を強いられる。

ニューヨークで若い女性が殺され、パキスタン系アメリカ人の青年が犯行の容疑者として起訴される。依頼を受けた弁護士の男は真相究明に奔走。青年はあからさまな人種差別に直面し、厳しい獄中生活を強いられる。