街はずれの工場内で、シリア出身のタクシー運転手アミール･アルハビの変死体が発見された。外に停車してあったタクシーの部品、金品が盗まれていることから強盗殺人のように思えたが、遺体の手指が折られているなど拷問の痕があり捜査は難航した。唯一の手がかりとなるのは、アミールの携帯電話に残された“C4121652”という謎のメモだった。キャッスルは、ひょんな事からメモの解読に成功。ベケットを連れメモが示す貸倉庫に向かうが、そこで2人は予想外の緊急事態に陥り…。
アメリカ滞在中の外国の王子が暗殺未遂に遭い、チームは捜査を開始するが、突然DCを訪れたディノッゾ･シニアに捜査を引っかき回されてしまう。任務がおろそかになるトニーにギブスは疑念を抱くが…。
殺しの脅迫を調査している最中にビルが爆発し、ジェーンとCBIチームは間一髪で逃げ出す。一方、事件で再び顔を突き合わせたリズボンと大富豪ウォルター・マッシュバーンの間に火花が飛ぶ。
アメリカ人を乗せた自家用機がヨーロッパで撃墜され、フライチームは搭乗するはずだった男の行方を追う。また、フォレスターは母親アンジェラから事件に関する情報を受け取って葛藤する。第1シーズンの最終話。
ジャンヴィエを撃ったカレンは釈放され停職処分になる。イラン政府から真相究明を命じられたヴァジリはカレンに接触し真相を追求する。情報提供者を守るためにカレン達は作戦を実行する。
