一夜を共にし、気まずい朝を迎えたメレディスとジョージ。マークがシアトルに来たことで、デレクとアディソンの間もぎくしゃくする。
ブレナンとブースは、上院議員と有力なビジネスマンが犠牲となった列車事故の調査に乗り出す。一方、ブレナンの母殺害の容疑者であるマクビカーが獄中死を遂げ、父親の行方を知る唯一の手がかりを失ったブレナンは途方に暮れる。
ヴァージニア州で、8歳の少女が誘拐される。そんな時、JJのもとに「8年前、今回と同じ犯人に息子を誘拐された」という女性が現れる。JJは最初、取り合おうとしていなかったものの...。
女子大生のドナとキャリーが車で事故を起こし救急救命室に運ばれるが、キャリーは昏睡状態となり、ドナは死亡する。運転席のドアポケットからビールの空きビンが見つかり、当初は飲酒による事故と思われたが、ミーガンの検死によって2人は何者かに撃たれたことが判明。ピーターとバドは2人の交友関係を探りに大学を訪れ、事件に関連するような一枚の写真を入手する。
拷問されていたキャッスルを助け出したベケットは司法省の分析官ヴィクラムと身を隠すが、再び襲撃を受けて意外な人物に命を救われる。ベケットはすべての発端が2年前に自分が司法省のデータベースでブラッケン上院議員について検索したことだと知り、真相に迫るため刑務所にいるブラッケンを訪ねていた。一方、キャッスルはアレクシスとヘイリーの協力を得てベケットの捜索を続け、ある手がかりを手に入れる。