ウィルマー・バルデラマ

シーズン幕開けは「NCIS ～ネイビー犯罪捜査班」のエピソードの続きからスタート。チームはマックスウェルがハワイに向かったとの知らせを受ける。飛行機を待ち伏せすると、中では数人が死亡しており、マックスウェルの姿はなかった。DCのNCIS捜査官トーレスとナイトも加わって捜査すると、マックスウェルが既にハワイに到着しており、環太平洋合同演習 (RIMPAC) への攻撃を計画していることが判明。チームがマックスウェルを発見した時、彼は近くに隠した爆弾のスイッチを手にしていた。

NCIS捜査官のニック･トーレスとジェシカ･ナイトがハワイにやってくる。彼らが担当した古い事件の鍵を握る重要証人が現れたからだ。

CIAの暗殺計画の発足メンバーが次々に死亡し、唯一の生存者であるキルブライドも命を狙われていることが発覚。暗殺計画を乗っ取ったモーガン･ミラーを追い、ワシントンのパーカーとトーレス、そしてハワイのテナントとルーシーもロスに飛ぶ。しかしキルブライドは姿を消し、ラウントリーが襲撃に遭って拉致され、さらに関係者全員が賞金首になっていることが判明。最悪の状況の中、各支局の捜査官が合同で決死の捜索を行う。

8歳の少年ブランドンが、友達のピーターに誤って銃で撃たれて担ぎ込まれる。2人でブランドンの母親の銃を持ち出して遊んでいるうちに起きた事故で、アメリアらが懸命の治療にあたる。一方、半年の謹慎処分を受けてやっと1カ月が経過したベンは、これ以上遅れを取ることに耐えられなくなり、麻酔科の面接を受ける。麻酔科の医師として復職すればオペはしなくても立ち会うことができるとジャクソンに語るが…。

ソフィアの監護権をめぐって法廷で争うことになったアリゾナとカリーは、同僚たちに証人になってくれるよう頼まなければならず、気が重い。さらにアリゾナはエイプリルのエコー中に気になることに目を留めたことで、エイプリルからなじられてしまう。一方カリーは、転んで背骨を折った高齢の男性を担当。彼には50年以上連れ添った妻がいたが、救急車に同乗してきたドアマンと実は恋仲だったと知り…。

オーウェンが新居を購入し、トレーラーを売却する。引き取られるトレーラーを見て、気持ちをざわつかせるメレディス。さらにアメリアとオーウェンが同居、もしくは、結婚するという話を聞き、機嫌の悪いままネイサンたちと一緒にオペに入ることになり…。一方、髄膜炎で入院してきたカイルは病状が悪化していた。心配するステファニーだったが、受診が遅れたのはステファニーのせいだとカイルの家族から関わりを拒まれてしまう。