エマ・トレンブレイ

ある航空機の事故からすべてが始まる。スーパーガールと不思議なつながりを持つトーマス･コーヴィルが、カルト教団を結成する。教団のパンフレットにクリプトン星の神のシンボルが描かれていることを知ったカーラは、集会に潜入して驚くべき事実を知る。一方、サムは娘のルビーに寂しい思いをさせているのではないかと悩む。ジェームズはカーラに過去の秘密を打ち明ける。

ナショナル･シティの海中に飛行機が沈んでいるのを、ウィンたちが発見する。その飛行機が宇宙船であることが分かり、スーパーガールが調査に赴く。一方、ハンクは父親のミリンとの関係を深めようとする。サムは、自分の身に起こる変化の謎について手掛かりを得ようと、養母のパトリシアの元を久しぶりに訪れる。

ナショナル･シティは、いまだレインの恐怖から逃れられずにいる。スーパーガールはレインの情報を求めて、サターン･ガールと、そしてかつての敵であるライブワイヤーやサイとも組み、ある人物が収容されているフォート･ロズに向かう。一方、ルビーからいじめの話を聞いたアレックスは、解決のために一肌脱ぐ。

レインを消すために宇宙に向かうカーラとモン=エル。思いがけず、生き残っていたクリプトン星人に出会う。カーラは大事な人との再会も果たすが、探し求めていたものを手に入れるには彼らを説得しなければならない。そんな中、ルビーと外出していたアレックスが攻撃される。レナはレインを閉じ込めておくために、どこまですべきなのか葛藤する。

今までにない強いパワーを手に入れたレインは、ルビーを捜す。ルビーを守ろうとするスーパーガールとアレックス。アレックスはルビーの元に、スーパーガールはサムの母親パトリシアの家に向かう。そこでスーパーガールは、サムの子供時代の驚くべき事実を知らされる。一方でジェームズは、スーパーガールに秘密を打ち明けるべきだとレナを説得する。

モン=エルとの別れが頭から離れないカーラ。スーパーガールとしての任務に全力を傾けることで、その悲しみを紛らわせようとする。結婚式を間近に控えたアレックスは、マギーにある秘密を打ち明ける。そんな中、ナショナル･シティの市民の1人と、カーラの間に不思議なつながりがあることが分かる。一方、レナは思い切った行動に出る。