美容クリニック勤務の麻酔医が自宅で首をつった状態で発見されるが、捜査は自殺ではなく他殺の方向へと進んでいく。
爆発事件で重傷を負ったクレイは、治療のため帰国。使用された爆薬から爆発の首謀者が明らかになり、ブラボーチームは彼らが潜伏しているとみられる郊外の工場へ向かう。
レイ奪還に成功し、外交的反発や印パ核戦争も回避できたが、ショウ中佐は本来の目的が達成できなかったと責任を追及。解散の危機に陥ったチームは最後のミッションに挑む。
陸軍分遣隊がマリのイスラム戦士に奇襲された。その際死亡した大尉の遺体を回収する任務に当たるブラボーチーム。一方、元シールズのスワンは心の病に苦しんでいた。
ジェイソンとレイとの関係が悪化し、ついに頂点に達してしまう。一方、士官候補生学校で最後の試験を控えたリサは、疎遠だった妹に会いに行くことに。