母親の誕生日に毎年、シカゴに帰省するモーガン。家族との再会を楽しんでいた夜、突然刑事によって少年殺害の容疑で逮捕されてしまう。ホッチは部下の容疑を晴らすべく、BAUチームを同行しシカゴ入りする。次第に明らかになるモーガンの知られざる生い立ちと、封印された過去の罪…。
工事現場で発見されたのは、5年前に失踪した主婦だった。冷凍された姿は、5年前と変わらない。失踪の翌日に捜索願を出した夫を疑うベケットだが、夫も既に殺害されており、捜査は難航。そこでベケットとキャッスルは死体の保管方法をわり出すことに。そんなある日、かつて夫婦が住んでいたアパートに、不審な冷凍庫が配送されたことを知る。事件の真相が少しずつ明らかになる中、徐々にキャッスルを信頼して行くベケット…。そして彼女は、死亡した母の壮絶な過去をキャッスルに打ち明け始める。
チームは海軍大尉が殺害された事件を捜査することに。その最中、トニーは会ったこともない大尉の姉にどんどん惹かれていく。
警察に保護されたアルツハイマーを患うシャーロット。敬虔なクリスチャン一家の一人だった彼女の夫は、ケンジントン街で殺害された。しかし、事件は未解決となっていた。シャーロットとその息子ライアンに同情したリリーは…。