カブール支局長のキャリーの元にCIA暗殺リストに載る人物の居所の情報がもたらされる。事実確認不足を感じながらも爆破に成功したキャリーだったが結果は最悪の事態に。
ある国際武器商人を捕らえたことから、NCISチームは海軍の極秘兵器システムが、“グルヌイユ”(アーマンド・アサンテ) と呼ばれる大物武器商人に売り渡されようとしていることを突き止める。
“オットー”と呼ばれる極秘のAI搭載車両が原因で海軍大尉が死亡する。ギブスたちは初動捜査で自殺を疑うが…。
シンクタンクの研究員、ホーク博士が自宅で殺害され、コンピュータのデータがすべて消去される。博士は国防省の新システムを研究中だったという。しかし、チャーリーがデータを復元したところ、そこにあったのは野球の成績を統計学的に分析する「セイバーメトリクス」だった…。
「死刑執行停止」の殺人犯が最悪な状態で戻ってきた。