アルツハイマー病を患う母親が画期的な治験を受けられることになり、リードは大喜び。そんな折、地元のバージニア州のアパラチア山道でバラバラに切断された人体が相次いで見つかる事件が発生する。確認された遺体は5人分。死後1年半近くたったものから1週間までと幅があり、犯行の間隔は徐々に狭まっているらしい。BAUと警察は雑貨店でドッグフードの缶詰を盗んだホームレスを容疑者として追っていく…。
森でキャンプをしていた家族が、木に吊された遺体を発見する。ゴースト･キラーの犯行と睨むブレナンは、遺体の頭蓋骨に遺伝的特徴を見つけ、被害者がトレント･マクナマラの姉ステファニーだと見抜く。衣服に付着した植物成分からマクナマラ家の庭師ドナが容疑者として浮上するが、ブレナンは彼女の骨格を見てあることに気づく。
FBIのフォーネル捜査官が過去に刑務所に送った男が脱獄した。フォーネルが脅迫を受け、彼の幼い娘まで巻き込まれたことからギブスはNCISに復帰。その脱獄犯がかつて起こした武装強盗事件を再捜査する。
無関係に思われた二つの事件は、ある復讐の企みで繋がっていた。
カーターとベントンは自動車事故で運び込まれた患者を担当、その男は異性服装倒錯者で人生に悲観していた…。スーザンは彼氏である精神科医デイブ･スベティックがうつ病の疑いを持つ。
