サル・ベレス・Jr

特捜班は、ボイト（ジェイソン・ベギー）の息子であるジャスティン（ジョシュ・セガーラ）が事件に関わっているかもしれないフィトーリ殺害事件を扱うことになる。グラディシャー（ロビン・ウェイゲート）は、内務調査部とボイトの間での取り決め事をアントニオに話す。それがもとで、ボイトとアントニオの間に摩擦が生じる。署内では、ルゼック（パトリック・フルーガー）が、バージェス（マリーナ・スケルチアティ）のプラット（エイミー・モートン）への仕返しに手を貸すことにする。

ペリー署長（ロバート・レイ・ウィズダム）は、カルテルの凶悪なリーダーを捕まえるために、プルポを釈放したと特捜班に知らせる。自分の息子を誘拐されたアントニオがいる特捜班とプルポの間には、遺恨が残り、それをすんなりと受け入れるはずもない。一方、リンジー（ソフィア・ブッシュ）の過去からよみがえった衝撃の事実が、ルゼック（パトリック・ジョン・フルーガー）を困惑させる。そして、リンジーの過去が明るみに出ることになる。ボイト（ジェイソン・ベギー）は、彼女が、取り返しのつかないところまで来てしまい、すべてを台無しにしかねないと忠告する。同時に、ジン（アーチー・カオ）もまた、問題を抱えることになる。

麻薬組織王の屋敷に突入した軍の特殊部隊が全滅する。情報漏洩の疑いがかかる民間団体TRPにカレン達は潜入するが、訓練中にTRPのメンバーの一人が死亡する。調査のために初めて現場に出たネルが捕らえられてしまう。

海軍の将軍の警護に当たっていたNCIS捜査官が殺される。本当の目的は将軍の暗殺だったのか、それとも狙いは捜査官だったのか。チームは捜査を進める。一方、ブロディは過去の事件について尋問を受ける。