ジャックが攻めに転じ、ゲインズの同僚をリムジン内で尋問し、妻と娘の居場所の手掛かりをつかむ。一方、ゲインズのアジトでは、事件の黒幕がテリーとキムの殺害と、アジトの始末を命じていた。そんな中、パーマーは、自陣営内の陰謀の存在を知る。
ブーンの事故後、ずっと姿を消していたロックが皆の前に現れる。
ビーチハウスで元CIAの男が爆死する。彼の家にいたのは高級エスコートクラブの従業員だと分かるが、そのうちの一人はカレン達の目の前で黒い車に乗った女に射殺されてしまう。一方でNCISのオフィスからは、この捜査を引き受けたヘティとグレンジャーが姿を消す。
スキナーが謎の病気に感染し、24時間以内に死亡するという。モルダーとスカリーはスキナーを救うため調査を始める。
クラブや家族の問題がジャックスの心に重くのしかかる。
