ジュリア・ベラ

ハネムーン先でのんびり過ごすことに飽きてしまったブレナンは、ブースを連れて遺体安置所へ。集団墓地から発掘された“消えた人々”の骨を見せてもらうが、遺骨の1つが最近のものであることに気づく。地元警察の捜査の手伝いを申し出た2人は、ジェファソニアンの協力も得ながらハネムーン中にも関わらず殺人事件の解明に乗り出す。

年配女性を狙った連続殺人事件を捜査するためメキシコへ向かう。

リリーを訪ねてロレインと彼女の婚約者の娘グウェンが訪ねて来る。20年前、グウェンの母はミラーの裁判での証言をできずに爆死。ミラーは証拠不十分で逮捕されず、グウェンは復讐心に燃えていた。早速、再捜査を開始したリリーは現場の分析を腕利きの鑑識官に依頼する。

スカリーは、モルダーとモリスの人格が入れ替わった原因を突き止め、元に戻そうとする。

噂の「エリア51」に向かったモルダーは、謎の現象に遭遇し別の人物と人格が入れ替わってしまう。

母親の葬儀に訪れた囚人アベルトが、棺から飛び出してきた男に射殺される。アベルトはマラ･ノーチェというギャングの一員だが、組織で禁止されている麻薬の売買を行い収監されたため、仲間の制裁を受けたのだ。