ジョン・クライヤー

イラクで撃たれたギブスは空母の外科エリアに運び込まれ、生死の境をさまよう。一方、ディノッゾとCIA局員のジョアンナ･ティーグはテロ組織“コーリング”を追い詰めるべく上海へ。今、シーズン13の幕が上がる。

南スーダンでボランティアの医師たちが襲撃される。その中にディノッゾの元恋人ジャンヌ･ブノワの夫がいたことから、ディノッゾはジャンヌと再会することに。ディノッゾとマクギーは殺人と誘拐の捜査を行うべく襲撃現場に飛び、行方不明になった医師たちの捜索に加わる。

ギブスが担当する事件の容疑者が負傷し、シリル･タフト医師 (ジョン･クライヤー) が手術を担当する。さらに重要な証拠を発見したタフトは、NCISのめまぐるしい捜査に巻き込まれることに。一方、スーダンの医師に関する手がかりをつかんだディノッゾは、再びジャンヌ･ブノワ (スコッティー･トンプソン) のもとを訪れる。

ニクスリィとレックスに愛する者を連れ去られたスーパーガールたちは、思い切った行動に出る。そして、意外な味方が現れる。

シリーズ最終話。レックスとニクスリィとの戦いに決着をつけようとするスーパーガールのもとへ、過去の仲間たちが駆けつける。一方、アレックスとケリーは結婚式の準備を進める。

レックスはレナを味方につけてリバイアサンの攻撃を撃退し、スーパーガールたちとリバイアサンとを戦わせるための巧妙な計画を進める。クライシスの後、レックスがどうやって権力を握ったかも明らかになる。