ジョン・ボイド

OAが子供の頃から通うクイーンズのレストランで爆破事件が発生。当初はテロ攻撃と思われたが背景にはより複雑な事情が隠れていた。OAは、更なる事件を防ぐため潜入捜査へ。

FBI捜査官を殺害した容疑で拘置所に収監されたブースは、囚人からも看守からも目の敵にされ、過酷な日々を送っていた。見かねたブレナンは調査で得た情報を使い、担当検事を脅迫。彼を釈放させる。自分を陥れた黒幕を捜そうと必死になるブース。一方、ブレナンたちは環境保護局の職員だったクーパーという男の遺体を掘り起こし、陰謀の真相を突き止めることに。病死とされていた彼が、実は殺されていた事実を突き止めるが…。

この世のものとは思えない謎の生物が、ＦＢＩ捜査官の臓器に寄生し、死の危険が迫る。一刻を争うこの事態は、パターンとの関係が極めて強く疑われた。オリビアは、ある服役囚に会うため、至急ドイツへ。この男こそ、さらに巨大な脅威の詳細を知る人物だった。一方、ビショップ博士とピーターは、オリビアを助けようと、死亡した男の脳波を探る。

和平協定は白紙に戻ってしまい、テイラー大統領は各国代表団に会談の中止を伝えようとする。しかし、ジャモ大臣の提案で、和平協定を続行しようとするが、ロシアが反対する。苦肉の策として調停役に選ばれたのは…。一方、CTUのクロエはヘイスティングスに代わり臨時支部長役を任命される。