妻殺しの容疑をかけられた男エリック・マセソンが、ライトマン・グループの事務所を占拠し、真犯人を見つけるまで全員を人質にする。その要求をのみ、警察を介入させないとのライトマンの決断は、命を落とすことにもなるかもしれない。
街のいかがわしい地区で海軍兵の死体が発見され、NCISチームは地元警察と共に捜査を進める。当初は誤って薬物を過剰摂取したことが死因だと踏んでいたが…。
バーニーとロビンは、大切な恋人に隠し事をしたことで、気まずい状況に陥る。一方、マーシャル、リリー、テッドの3人はコンサートに行く。
レストランに火だるまの男が現れ死亡する。身元は不明で遺体から放射性医薬品が検出されたためNCISが捜査に乗り出す。被害者の家からSEALのバッジが見つかり、元SEALを名乗り偽名を使っていたことが分かる。
連邦刑務所に収監されているモーを監視するためサムが刑務所に潜入する。一方でテロ組織を追うため刑務所にはネイトが潜入していた。しかし密告者によってサムとネイトの正体がバレそうになる。