トリエスト・デュン

あるセレブのスキャンダルをきっかけに、複数の殺人事件が起きる。一方、ホームズに探偵生命を脅かす病気が発覚し苦悩する。同じ頃、かつてホームズに救われたと語るマイケルが彼に近づいてくる。

脊髄液を抜かれて殺される事件が発生した。フリンジ･チームが捜査を開始するが、被害者は増え続ける。やがて捜査線上に、ある科学者の名前が浮上する。それは、テロリスト組織との関係が疑われる人物だった。チームは、犯人の正体と殺人の動機を知り、衝撃を受ける。さらに同様の殺人が次々と起こり、一刻を争う事態に。オリビアたちは何とか犯行を食い止めようとするのだが…。

ZIPがいよいよ船でアメリカに向かう中、新たなタトゥーの謎が届く。それはどれもジェーンが過去に暮らしてきた街の新聞に載った広告で、広告主は架空の企業だった。パターソンは解読に全力を注ぎ、発信元の場所がマルタだと突き止める。マルタに飛んだザパタはCIAのキートンと再会する。しかし話をするうちに、ザパタは彼の言動に違和感を覚える。一方、謎解きに苦戦していたパターソンは、これが罠だと気づく。

ジェーンはZIPを浴びたものの、パターソンの作った薬のおかげで記憶を失わずに済む。事件は解決したが、グリゴリアン長官はチームを解雇する。彼らは一切の罪に問われないが、二度と政府機関で働けなくなる。だが、全て回収したはずのZIPの容器が1つ足らないことが判明する。事の重大さにグリゴリアンは、チームの捜査続行を認める。そんな中、ジェーンはロマンの幻影に遭遇する。ZIPがジェーンの体をむしばんでいたのだ。

タトゥーの解読から新たな発見があり、チームは美術館で開かれる寄付集めのパーティーに潜入する。館内で2人の遺体が見つかり、ジェーンが犯人の後を追うが逃がしてしまう。次のターゲットが判明すると、チームは先回りして犯人を捕らえるが、ここで意外な事実が判明する。一方、ロマンと共にカナダを訪れたジェーンはシェパードの過去を知る。

匿名の情報提供者からタレコミがあり、チームは緊急を要する死刑囚の事件を調査することになるが、ザパタはそのためにおとり捜査を行うことにする。“モグラ狩り”の最中に捕まりそうになったジェーンは、FBIのもとを去ることを考え始める。