ニール・ホプキンス

ゴミの埋立地で青く染まった鳥が大量に死亡し、その中から青い遺体が発見される。遺体は化学物質にさらされ、頭皮と髪の毛がはがされていた。アンジェラの復顔から被害者が高級サロンの人気美容師サンティアゴと判明した。

BAUが複数の殺人事件と、既に死刑に処された連続殺人犯とのつながりを探す。

高級住宅街で、強盗に殺されたと見られる警備員の死体が発見され、CBIが捜査に駆けつける。だが、実はそれが、若い夫婦の誘拐事件で、犯人が身代金を要求していることが分かり、CBIは、次の動きを慎重に検討していた。そんな中、誘拐されたはずの夫婦が、事件のことも知らずに休暇から戻ってくる。一方ジェーンはFBIの拘置所から突然消えたローレライの調査を続ける。

操車場に置かれた不審な車から、女性の変死体が発見された。被害者は天文物理学者のマリー･スバラオ。顔は今にも破裂するほどに膨れ上がり、検視官のラニは車内で宇宙空間と同じゼロ気圧にさらされた“爆発的減圧”による死亡と断定。その直後、キャッスルは車内から宇宙人の誘拐に関する本を見つけ出し“宇宙人が誘拐中に殺した”と想像を巡らせる。すると、被害者の鼻腔から謎の金属も検出されたという。そして遂には、キャッスルとベケットの前に政府組織が立ちふさがり!?

ビーチを離れ、安全な洞窟への移住を決めた生存者たち。そんな中、人気バンドの元メンバー、チャーリーはドラッグの禁断症状と必死に闘っていた。

ジェイコブの後任として新たに島を守るという任務を背負ったジャックと、やっとデズモンドを捜し当てたロック。いよいよロックが島を破壊するときが来たと悟ったジャックたちはそれを止めに向かう。一方ロサンゼルスでは、ひき逃げを自首して出頭したデズモンドが、ケイトとサイードを連れて護送車から逃走。その晩、自然史博物館ではウィドモアの妻が主催する慈善コンサートが開かれる。デズモンドによって引き合わされたケイトとクレアが会場で見守る中、ピアニストのダニエルとチャーリーのバンド“ドライブシャフト”の共演ステージがはじまる。