バリー・W・レヴィー

殺人の現場を目撃した証人が、犯人の送り込んだ殺し屋から逃れるためたった一人でジャングルに逃げ込んだ。スティーヴ達はこの証人を救出に向かう。一方ダニーの元妻レイチェルと愛娘グレイスの乗った車が襲われ、自宅が荒らされるという事件が発生、ダニーは2人を守るための行動に出る。

誕生祝賀祭の会場で3発の銃弾を受けた大統領グラントは、ジェームズ･マディソン病院に緊急搬送される。副大統領サリーは、サイラスの指示も待たずにホワイトハウスに入り、勝手に陣頭指揮を執り始めていた。混乱するホワイトハウスで、サイラスとサリーは激しく対立。そんな中、報道官のケイガンも銃弾に倒れたため、オリヴィアが一時的にホワイトハウスに戻ってくる。グラントの容態を案じながらも、かつての思い出に心を寄せ、毅然とした態度で再び会見の場に立つオリヴィア。予断を許さぬ状況が続くグラントは…。

待ち伏せに襲撃されてモルダーとクライチェックは離れ離れになり、クライチェックはスモーキングマンと取引をする。一方スカリーは、姉の襲撃犯がスキナーの襲撃犯と同一人物であることを知る。

モルダーが自殺したという嘘をスカリーがついたことで時間を稼ぎ、モルダーは洞窟の中のものとよく似た死体を発見する。氷床のサンプルから発見された生命体とスカリーのDNAを結びつけることで、スカリーの治療法の可能性を見出す。

サム･ハンナ特別捜査官は、ネイビーシールズ時代の元同僚が麻薬ディーラーの殺害事件に関与していたと知る。

モルダーは、カナダの山中で発見された凍結物が宇宙人の存在を示すものであることを証明しようとする。だが、真実を探求することで、さらなる嘘や信じられない結末に導かれていく。