モルダーはプエルトリコでのエイリアンとの接触を調査するため、新しい仕事を辞める。そしてスカリーは、彼の失踪についてFBIに質問され、手がかりを追い始める。
スキャンダルで失脚した州検事の妻として、アリシア・フロリックは弁護士に復帰し、家族のために新しい生活を始める。最初の訴訟は、元夫の殺害容疑で逮捕された女性の再審理だ。
自称 “ビッグフット” ハンターの3人組が何者かに襲われ惨殺される。現場には大きな裸足の足跡が残っていたが遺体は動物に引き裂かれたような跡があった。唯一生き残った女性は怯えきった様子で “ビッグフット” に殺されたと話す。
マフィアに関連した連続殺人が、新世代のギャングの存在に捜査班を導く。
非番中にガソリンスタンドで強盗に遭遇したダニーはやむを得ず発砲。そのことはダニーの心の傷となり、家族や同僚を心配させる。エディは無賃乗車をした少女を捕まえるが、銃の情報と引き換えに見逃してほしいと頼まれる。その銃はエリンの事件の重要な証拠品だった。