5年前に誘拐された双子の死体が、地中に埋まったタンクの中から発見された。遺体の検視が進む中、ブレナンとホッジンズが誘拐犯“墓掘人”の手に落ちる。生き埋めとなった二人は、ブース達に必死で場所を知らせようとする。
ギャング同士の抗争から派生した殺人事件が起こる。捜査を開始した重大犯罪課だったが、レイダー警部は自らのキャリアを潰しかねないほど大胆な手法を使って、事件の解決を図ろうとする。だが、それによりサイクス捜査官の命を危険にさらしてしまうのだった。一方、実の父親の存在を知らされたラスティだが、会いたくないと言いだす。
アメリカの公選弁護人の遺体がメキシコで発見され、FBIとジェーンが駆けつける。だが、彼女が国境を越えた記録がどこにもない。フィッシャーが懸命に聞き込み調査を続ける中、ジェーンは思いも寄らない方法で謎を解いていく。一方、リグスビーとヴァンペルトは、元CBIのメンバーを狙っているのが誰かを探るため、ラローシュに協力を求める。
ニューメキシコ州ラスベガスの深夜のダイナーで陰惨な強盗殺人事件が発生する。犯行後、店は放火された。この町では6年前にも似た事件が起きており、BAUは同一犯と模倣犯の両面から捜査を始める。さらに、6年の間に別件で逮捕され服役していた容疑者に絞り込むとデューク･メイソンとレスター･ターナーの2人が浮上。メイソンの子どもを産んだ元恋人に話を聞きに行くが、母子ともにメイソンにさらわれていて…。
ニューヨークでは、ジャック･バウアーが、娘のキム夫妻と愛してやまない孫と一緒に幸せな時を過ごしていた。ところが、そんな彼の下に負傷した情報屋のビクターが、暗殺計画の情報を持って駆け込んで来る。そして、ジャックの長い1日が再び始まろうとしていた。
