マイケル・チーフォ

300年前の骨を握りしめた死体が発見された。ブレナンとブースの捜査の行方は、海賊の財宝が眠っているとされる島へと導かれる。ところが、ダイビング調査中に発見された骨のいくつかは、ジェファソニアン研究所から持ち出されたものと判明。そこには思いもよらぬ犯人の利己的な動機があった。

LAでこの2カ月に4件の銀行強盗が発生。人質に服を脱ぐことを強要するのが特徴だった。ギデオンは、犯人の狙いは金ではなく、恥と屈辱を与えることだと分析。

州の墓地で遺体が発見される。遺体は頭部を撃たれ、股間に花束が置かれていた。CBIメンバーに招集がかかり、一緒にいたリグスビーとヴァンペルトも現場に向かう。CBIに戻り、ボスコのオフィスを訪れたリズボンたちは信じられない光景を目にする。ヒックスをのぞくボスコのチーム全員が撃たれており、かろうじて生き延びたボスコも瀕死の重傷を負っていたのだった・・・。

重大犯罪課チームは、自殺かどうか疑わしい事件を捜査しているうちに、死が目前に控えている男と覚せい剤漬けの元妻との間で持ち上がっている厄介な親権争いに巻き込まれる。一方、ポープはロス市警の本部長に立候補するが、ブレンダはそれに待ったをかける。

15年前、キャサリンは地元の女子大生を強姦し、殺害した男が処刑になるように力を入れた。新しいDNA鑑定検査の証拠でその男は処刑を免れる。

少女の誘拐事件をきっかけに、モルダーとスカリーは被害者との間に異常なほどの霊的つながりを持つ女性の助けを求める。