マイケル・ブライアン・フレンチ

パーマーを守ろうとする行動が裏目に出て、ジャックは暗殺容疑者に仕立てられる。ジャックは、自分を弁護できなければ、FBIに尋問のため連行されることになる。一方、収容所では、テリーとキムが捕虜としての立場を受け入れようと、お互いを助ける。

ホームズとワトソンは長い間、鳴りを潜めていた連続殺人犯がニューヨークの彫刻家の殺人を機に殺しを再開したと見て捜査する。ワトソンはホームズがIT長者のオーディン･ライヘンバッハについて何か隠しているのではと疑う。

UFOの技術を利用した航空機を操縦していたテストパイロットが失踪した。モルダーとスカリーは真相を探るために政府に反抗することになる。

霊能者の予言に導かれ、ブレナンとブースは噴水の下から複数の遺体を発見する。一方、昏睡中に見た夢の影響でブレナンに恋していると思い、ブースは戸惑う。歌手のシンディ･ローパーが霊能者役でゲスト出演。

マイケルたちは次のスキュラの番人を探し出さなければならなかった。期限は1日! さもなければ刑務所に戻されてしまう…。

ますます病状が悪化するマイケル。そしてスキュラが保管してある組織のビルへの侵入経路を探し、隠し通路を進むメンバーたち。ついに尊い命が犠牲に…。