ブロディの帰還から3日。再入隊が要請されるが、本人はトラウマに苦しみ不可思議な行動をくり返していた。そんな中、キャリーの元にナジールに関する有力な情報が入る。
レイチェルと恋人ジュリーの狭間で悩むロスに、チャンドラーとジョーイは、2人の長所と短所のリストを作ればいい、と言う。しかし、そのリストをレイチェル本人が発見し、短所リストの内容に大激怒! いくら謝っても許してもらえず、失意のロスは…。
ホテル王ヴィクター・バロン主催の権威あるミスコン“バロンの美人コンテスト”のリハーサル中に、女性の変死体が発見された。被害者はイリノイ州出身の出場者、アンバー・ミドルベリー。コンテストの“たすき”で首を絞められていた彼女は、照明の上に寝かせられていた。関係者に聞き込みをすると、事件当夜アンバーは楽屋で男性と激しい口論をしていたという。そして彼女のバイオリンケースからは秘密の写真が見つかり、ベケットたちは撮影した写真家を探っていく。
噂の「エリア51」に向かったモルダーは、謎の現象に遭遇し別の人物と人格が入れ替わってしまう。
スカリーは、モルダーとモリスの人格が入れ替わった原因を突き止め、元に戻そうとする。