ジェーンとCBIチームが、囚人の殺人事件を調査するために呼ばれる。殺された囚人はレイプ殺人で9年服役していたが、DNA鑑定の結果、最近釈放されたばかりだった。ジャック・コールマンが犠牲者の夫役でゲスト出演する。
法廷担当記者のデイナが、60年以上経過した、ある死亡事故を掘り起こすようリリーに依頼してくる。デイナの大叔母アリスは、1943年、働いていた工場で転落死していた。しかし、アリスの元同僚マーサの証言から、他殺の可能性が浮上してきた。
レイプされ、血だらけになって逃げ出してきた被害者。犯罪現場は、300ヘクタールもの広さのセントラルパーク。被害者は記憶を失っており、彼女から採取された精子から犯人は無精子症だということが発覚する。DNAも採れず、犯人逮捕は遠のいたかと思われた。何としてでも犯人を特定するため、CSI達は全力で捜査を続ける。残された証拠が語る、衝撃の事実とは!
ブレットポイントというシステムが銃声を探知し、ホームズとワトソンは銃撃事件の捜査に乗り出すが、犯行の証拠を見つけるのに苦労する。そしてシンウェルに降りかかった災難は図らずも過去の未解決事件へと繋がっていく。
何十年も前にヘンリーの同僚を射殺した容疑者を見つけたフランクは必死に証拠集めをする。一方、ダニーとバエズはポルノ映画業界で起きた連続殺人事件を捜査する。