ある男性が、農作業中に農機具で遺体を轢いてしまう。身元が判明し、被害者ベンジーの兄の自動車整備工場を訪ねたブースとスイーツは、ベンジーがコートニーという女性と最近別れたと聞く。コートニーを聴取すると、ベンジーがタイムトラベルの実験をしていたことがわかる。
散歩中の夫婦が白骨遺体を発見するが、検証中にもう一つの遺体も見つかる。遺体の一つは、肺がんで亡くなったモニカ・クレイグと判明。その場所は自然葬を行う会社が借りていた土地で、モニカは埋葬されていた。もう一つの遺体は、モニカの葬式コンサルトと判明するが…。
イリノイ州シカゴの食堂で16歳の少年ギャヴィン・ロスラーが発砲し3人を射殺したが、たまたま居合わせた非番の警官に射殺された。向かいの防犯カメラに映っていた映像から、彼は約4年前に起きた未解決失踪事件の当事者だったことが判明。ギャヴィンを食堂まで送っていった運転手はギャヴィンの失踪後24時間以内に失踪した17歳の少年トレヴァー・マディソンだと分かり、その後彼は路上で車に立てこもり自爆した。少年たちを拉致した犯人は、何年もかけて兵士として育てあげ、機が熟すと少年たちに任務を遂行させたのだ。
パーマーは副大統領と閣僚が集まった公聴会で、大統領としての資質を問われることに。そんな中、ジャックは偽造テープを作ったハッカーの潜伏先、キプロスへ向かう。一方、キムは自分の荷物を取りに、ミーガンの家へと戻ってくる。
巨大なマイアミ刑務所内の広場で囚人が刺し殺された。ホレイショが現場に到着するや否や上空にヘリコプターが現れる。殺人は脱獄のためのおとりだったのか。