ワトソンが休暇で不在の中、ホームズとキティはダイヤモンドの不法取引に絡む殺人を捜査。トーマス･グレッグソン警部は、娘が別の警官との交際中に暴力を受けたと知り、ある一線を越えてしまう。
エセ科学などを暴く懐疑論者の殺人を捜査するホームズとワトソン。国土安全保障上の潜在的脅威が見つかり、警戒レベルが高まる。
ワトソンが殺人容疑をかけられた事件を捜査するホームズ。彼は探偵業、友人、そしてワトソンとの関係全てに影響する重大な決断を下す―。
竜巻の恐怖が街を包み、ハーマンは竜巻の発生地域が自宅に近いことを知る。チリとブレットは、チリの重大なミスのため、要救助者の呼吸が止まり頭が真っ白になる。そしてブレットはチリの行動がおかしいことをボーデンに報告する。一方、オーチスはドーソンに、女性にもてるためにはどうすればいいかを相談する。セブライドは国土安全保障省のアレックス･ウォード捜査官に頼まれ、ある家の捜査を手伝う。
正体不明の脅威がシカゴの街をおびやかし、51分署も警戒を強める。出動要請がかかり、駆けつけた現場で、救助隊とはしご隊が銃乱射事件に巻き込まれてしまう。ケイシー小隊長は、竜巻の被災者のために集められた寄付金の行方を粘り強く調べていた。一方、ジミーは、51分署と警察21分署による第1回目のボクシング試合で署の代表として出場することに同意する。チリは相変わらず突飛な行動で、救急隊の相棒であるブレットとの間の溝は深まっていく。
