リンダ・ハミルトン

チャックとモーガンは、チャックの母、メアリー･バトウスキーを捜し出すという任務を背負い、世界中を駆け回る。そして、サラとケイシーは、ヴォルコフ･インダストリーという謎めいた企業を支配する男、マルコを追ってロシアに来ていた。一方、チャックは、うれしいニュースを伝えようと彼の帰りを待っていたエリーに、スパイ生活に戻る話を切り出せなくなる。

チャック、サラ、ケイシーの3人は、モロッコに飛ぶ。偽造貨幣の捜査をしているロン･モンゴメリーが、偽造組織に捕まり、彼を救出しなければならないからだ。そんな中、チャックとサラは、互いの将来についての意見が平行線をたどり、言い争う。一方、モーガンは、アレックスの母に会う。また、メアリーは、初めて母親らしくエリーに寄り添い、幸せを感じる。

サラがヴォルコフのもとでメアリーの救出作戦を進めている頃、チャックとモーガンは、独自の方法でヴォルコフを打倒しようとしていた。だが、2人はヴォルコフの罠に掛かり、一気に危険度のレベルが上がる。一方、エリーの出産に立ち会うデヴォンは、不安と緊張でいっぱいになるが、意外なことにケイシーに勇気づけられる。そして、赤ちゃんは無事に誕生し、みんなが駆けつける。

サラから婚前契約書を渡され動揺していたチャックは、彼を殺そうとしていたヴィヴィアンを暗殺する、という任務を命じられる。ヴィヴィアンの無実を信じるチャックは、それを証明するために、彼女の父、ヴォルコフに接触しなければならなかった。一方エリーは、父の過去に関する調査を進めていたが、母がそれを妨害しているのではないかと疑念を抱き始める。

ホイールライト博士が、自分が開発した装置で毒ガスをまき散らそうとし、チャック、サラ、ケイシー、モーガンの4人は、博士を止めようと必死になる。そんな中、チャックは、自分の母が誰のスパイなのか把握できず、焦り始める。ハロウィーンを目前にした バイ･モアの店内は、ユニークで不気味に飾りつけられ、エリーとデヴォンは もうすぐ生まれる赤ちゃんのために準備を進める。

サラは、メアリー･バトウスキーを救出するため、多大な危険を承知の上でヴォルコフに接近するが、チャックはそんな彼女を事態に深入りしすぎていると心配する。だがサラは、ヴォルコフとの間で交わされた極秘の任務を遂行するために、チャックとモーガン、ケイシーに援護を要請する。一方、エリーとデヴォンは、子供の名前について意見が合わず言い争う。