ボストンで男性3人の絞殺体が発見された。犯人は絞殺具を用い、夜に襲撃、財布を奪っていたが被害額は大金でなく、カードも使用していない。目撃者はいないが、3人目の被害者スコットは友人との電話中に襲われ、1時間後、遺体で発見された。現地に入ったBAUが捜査を進めるうち、犯人は被害者を監視して、特定のタイプを狙っていたのではないかと思われた。やがて犯人があるビルの住人を監視し、住人に悪影響を与えていた関係者を殺していることが判明する。犯人が被害者を狙う基準は一体何なのか…。
ゴルフ場で海軍兵曹の他殺体が発見される。マクギーは被害者のアマチュア無線につきっきりで、重要な証人を捜し出そうとする。一方、パーマーはどんな子供でも遊べる遊び場を作るために同僚から寄付金を募るが、トーレスは気前のよさで皆を驚かせる。
ニューヨークで爆破テロが発生! 容疑者は新人FBI捜査官アレックス。その9ヶ月前、彼女はバージニア州クワンティコにあるFBIアカデミーに、全米から集まった精鋭たちと共に入学したばかりだった。アカデミーでの【現在】、爆破テロが起こる【未来】が交錯しながら、アレックスは“真実”を求め奔走し始める! 果たして、彼女を陥れたテロの真犯人は一体…?
NCISのチームは携帯電話が爆発し海兵隊員が死亡した事件を追う。再び爆発が起きる前にチームは対処しなければならない。
閉鎖された刑務所の跡地から、囚人服を着た白骨死体が発見された。認識番号から、死体は囚人のハンクと判明。だが、記録によると彼は刑務所内で死亡し、火葬されていた。なぜか、署長を含む刑務所ぐるみの隠蔽工作が行われたのだ。そんな中、ハンクの脱獄歴が明らかになる。
