レオン・ラッサム

ダナ・スカリー捜査官は、フォックス・モルダー捜査官によって再開されたX-ファイルと呼ばれる事件の捜査に巻き込まれる。

建築作業員が、膝蓋骨が手術で取り除かれた神父の遺体を発見。それは“父亡き息子”連続殺人事件の新たな被害者だと判明する。アンジェラが被害者を示すと思われる図柄を発見したことで、ブースたちは犯人がある法則に従って被害者を選んでいることに気づく。

ティーバッグは行方不明のホランダー夫人を探し、カンザス州にたどり着く。スクレの乗る飛行機が乱気流に呑まれる。ベリックが元職場の刑務所に戻ると事態は急転、マイケルとリンカーンは収監された後フォックスリバーに戻ることに。

マホーンは全てを投げ出して、パナマまでマイケルを追ってくる。彼の驚くべき目論見とは。裏切りを阻止しようとするキムは、マホーンと銃撃戦となる。スクレは命を賭してマリクルーズを探し、ティーバッグは決定的な間違いを犯す。

大統領の突然の辞任のため、リンカーンの無実を証明する手立てを失ってしまったマイケル。サラはマイケルとリンカーンの自由のために、自らを犠牲にする事を考える。ティーバッグはメキシコで逃亡を続ける。サラと会えないまま、マイケルはパナマに到着し…。

マイケル、リンカーンそしてケラーマンがTV放送をハイジャック、行方不明のサラにメッセージを伝える。ニュースで彼らの映像を見たサラは、そこにメッセージが隠されていることに気付く。ベリックは所内の診察室で予想外の訪問者に出会う。