生物兵器はすでに国内に届いている、と知ったジャックはトニーに連絡し、港に向かう。一方、官邸では、ジャックがメイヤー議員を殺して逃亡した模様との報告をモスから受けたケニンが、大統領に首席補佐官を辞任すると申し出る。
スタークウッドに踏み込んだFBI。そこでFBIを待ち受けていたのは…。
ジャックはメイヤー議員の元へ。そこで得た新たな情報とは…。
生物兵器による症状に苦しむジャック。だが、アメリカを守るために耐えていた。そしてトニーも、生物兵器の脅威からアメリカを救うために奮闘していた。
テロの標的は官邸だった。携帯電話を水でダメにしてしまったルネは何とかFBIにこの事実を知らせようとするが、敵の1人に見つかり追われる身。その頃、ジュマたちは官邸へ通じる水路を通って建物の地下に潜入していた。