ウォーカーのBAP時代の同僚サムが心臓発作で倒れた。フルマラソンを走るくらい健康なサムの心臓発作に違和感を覚えたウォーカー。倒れたときの状況から、サムは放射性物質を注射されていたことが分かり、さらにサムは被爆による多臓器不全を起こしてしまう。サムが無作為に選ばれた被害者だとにらんだBAUは、サムの前にも連邦職員が2人、いずれも心臓発作に似た症状で入院し、多臓器不全で亡くなっていたことを知り…。
タイムラインをひも解く“糸”の正体が明らかになったことで、彼を全力で守るというチームのミッションは各エージェントに自分の価値観を疑わせるようになる。
ケイトはトビーの心臓発作後、自分の感情に悩む。ウィリアムがジェシーと過ごす時間が増え、ランダルは父親の新しい関係に慣れなければならない。三つ子の妊娠の知らせを受けたジャックとレベッカは、3人の赤ちゃんが住む家を買う方法を見つけなければならない。オリヴィアは予期せず再登場し、ケヴィンとスローンの両者を混乱させる。