ヴァージニア州ブリストルで、拷問されたあと感電死した若い女性2人の遺体が見つかり、死ぬ直前に親しい人に電話をさせられたことも判明した。20年以上前に起きた“虐殺者 (ブッチャー)”と酷似していると気付いたホッチは、当時の事件担当者ロッシを呼び出す。休暇を切り上げ、未解決に終わった忌まわしい連続殺人を再度見直すロッシ。その一方、過去の事件を紐解き共通点を見つけたBAUは、犯人はブッチャーのファンの2人組だと発表するがロッシは納得いかない。
海軍少佐が殺害され、NCISチームは捜査を開始するが、少佐の夫が取り乱して現場に乱入してくる。一方、レイが帰国し、ジヴァは将来について思案することに。
25年前、成績優秀、スポーツ万能で女子に人気のあった男子大学生が銃殺される。事件は迷宮入りしていたが、今になって何者かが男子大学生の墓石に“レイプ犯”とイタズラ書きをする一件が起こる。リリーたちは複数の女子学生が彼から性的暴行を受けていたにもかかわらず大学側も警察もしかるべき対応を取らなかったことを突き止め、被害に遭った女子学生の犯行を疑う。
ベントンの甥ジェシーのガールフレンドが暴行され治療にやってきた。彼女の話から、ジェシーがトラブルに巻き込まれていたことを知ったベントン。彼女から犯人の名前を聞き出し、警察に通報する。術後、下半身麻痺になった患者から訴えられたコーデイは、法廷に召喚される。原告の弁護士による鋭い追求に、思わず自分のミスを認めそうになるが…。