ニコラス・リー

性別を変えることができる人物が、宗教団体と関係のある殺人事件を起こしていた。

緊迫した人質交渉の中で、モルダーはエイリアンの実験の犠牲者だと主張する殺し屋に同情してしまう。

ディーンが、時間の神クロノスとともに1944年のシカゴにワープしてしまい、銃を所持していたため直ちに逮捕される。そして、映画『アンタッチャブル』に登場する伝説の刑事エリオット･ネスがディーンを尋問する。一方、目の前でディーンとクロノスが消えるのを目撃したサムは、ディーンを現代に連れ戻す方法を探るが、それはまさに“時間との戦い”だった。

スカリーが超自然的な力によって拉致されてしまい、モルダーは必死に彼女の捜索に乗り出すが、見事な裏切りに阻まれてしまう。

モルダーと新しいパートナーのアレックス・クライチェックは、夢の中で殺人を行う能力を持つ可能性がある、睡眠不足の海兵隊員に立ち向かう。

ネイティブアメリカンの神秘的な儀式により、モルダーは蘇る。一方、スカリーはエイリアンの実験に関する秘密のファイルを追い、知らず知らずのうちに命を狙われる羽目になってしまう。