県立田茂農林高校、通称『のうりん』に通う畑耕作は超人気アイドル・草壁ゆかの熱狂的なファンである。いつか彼女と一緒に都会で農業をすることを夢見ながら、幼なじみの中沢農や親友の過真鳥継たちと学校の実習に精を出していた。そんなある日、TVから流れてきたのは「草壁ゆか電撃引退！」のニュースであった。

突然引退してしまった人気アイドル・草壁ゆかこと、木下林檎が転校してきたことに驚きを隠せない耕作たち。寮生になるという林檎のために農や継と共に歓迎会を開くこととなったのだが…。

今日は林檎の初実習。畑に向かおうとする林檎の格好は農の策略によりなぜかビキニアーマーとなっていた！ そこに自らハイレグアーマーを装着した農が現れ、壮絶な実習バトルが繰り広げられることに!?

ある日、大切に育てていた畑を何者かに荒らされる事案が発生！ 目撃証言から犯人を割り出したところ、どうやら猿が侵入していることがわかった。耕作たちはあの手この手で猿対策を講じようとするのだが……。

学校内で作っている味噌をもらいにB組・生物工学科に向かった耕作、継、林檎の前に現れたのはB組の学級委員・鈴木燈、またの名を…バイオ鈴木！ 味噌と引き換えに耕作と継は新製品の試験を頼まれるのだった。