「俺は今、異世界を……ひとりぼっちで攻略している」 クラスメイトたちが仲の良いグループで思い思いに過ごす高校の教室に、突如魔法陣の光が輝き、クラス丸ごと異世界召喚されてしまう。敢えて”ぼっち”な時間を満喫していた高校生の遥も例外ではなく……しかも、逃げのびようと悪あがきをしてしまったために、神様からのスキル選択に出遅れ――!? チートスキルは早い者勝ちで、すでに取りつくされており、残りは役に立たないバッドスキルばかり。神様に異議を申し立てていたら、残りのバッドスキルを全て押し付けられてしまう。そして、スキル『ぼっち』のせいでパーティーが組めず一人で冒険を強いられるが、遥は快適なぼっちライフを送るべく準備に取り掛かるのだった。

「ひとりぼっちで……異世界攻略してやるんだ！」 ”ぼっち”で異世界を満喫することを決意した遥。そんな彼の前にクラスメイトの不良たちが現れ、スキルで女子たちを手込めにしようとする企みを聞いてしまう。さらに遥の住む洞窟の前で、仲の良かったオタたちがゴブリンと戦闘を繰り広げていたところに出くわし、加勢して迎撃に成功。その後事情を聞いてみると、クラスメイトの異世界での生活の拠点を不良たちが破壊したことでクラスの結束は崩壊、その責任をオタたちがクラスメイトから押し付けられ、拠点から追放されたようで――!? 知ってしまったからには、遥はクラスメイトの様子をこっそり見に行こうとするが、目の前に委員長が現れる。

「俺はいつまでたっても『にーと』なんだ……う、くう……」 無事にオムイの街に到着し、女子たちは大はしゃぎ。早速冒険者になるために遥と委員長たちがギルドへ向かい、続々と冒険者登録を済ませていくが、レベル10以下では冒険者になれないことが判明。レベルが10に達していない遥は冒険者になれず、さらにはパーティーに所属していることまで条件と言われ落ち込むのだった。翌日これまでに入手した大量の魔石を鑑定に出し大金を受け取った遥は、怪しげな武器屋を紹介される。時間を忘れ物色していると、うっかりいくつものアイテムを複合してしまい、有り金全てを失ってしまう。再び魔石を集めるため、委員長の目を盗みこっそり森に帰ろうとするが……。