野球の名門・青葉学院から墨谷二中に転入した谷口は野球部に入った。青葉では2軍の補欠だった彼に墨谷ナインは大きな期待を抱いてしまう。本当の事を言い出せない谷口は、特訓で実力を付けていく。野球部キャプテンは、そんな谷口を次期キャプテンに指名するのであった。

新学期を迎え、谷口が新キャプテンを務める墨谷二中野球部も新たな部員が入部。初練習を始める谷口だがノックができない。あきれる部員達だったが、数日後には特訓で克服。そして迎えた地区予選、江田川中との一回戦。苦戦する墨谷だったが、新入部員・イガラシの助言で…！

地区予選二戦目を前に谷口は1年生・イガラシの起用を検討していた。しかしナインからはその考えに猛反発を受ける。谷口は迷うが、やはり試合に勝つ為にとセカンドを丸井からイガラシに変更する。やがて金成中戦が開始、墨谷は相手からコンピュータで調べ尽くされ大苦戦！

データ以上の力を発揮し、金成中を破った墨谷は勢い付き、ついに決勝に進む。その相手は谷口のいた名門・青葉学院。谷口は青葉に勝つ為、猛特訓を開始するがあまりの過酷さにナインは反発、抗議のため谷口の元に向かう。だが、そこでは一人特訓に励む谷口の姿があった…。

青葉学院との決勝戦開始！青葉は地区予選決勝と侮り、二軍をスターティングメンバーにしてきた。だが、猛特訓を重ねてきた墨谷ナインは、エース松下が打ち込まれるものの守備と打線で青葉二軍選手と対等の試合運びを見せる。しかし、ついに一軍のエース・佐野が投入され…。

谷口の特訓は、エース佐野を想定していたものだった。墨谷は名門青葉を相手に互角のまま大詰めを迎える！青葉の監督は、過小評価していた墨谷に脅威を感じ、九回の攻撃で選手を一軍と総入れ替えする。さらに墨谷エース・松下が負傷、リリーフのいない墨谷は窮地に立たされる！