ウィンダリア島に漂流人（さすらいびと）として流れ着いた少年・リックは、三人の少女──アミル・ネリス・エアリィ──に助けられ、彼女たちの営むパン屋「ル・クール」で職人として腕を振るっている。おいしいパンを焼いて人々に届ける、忙しくも穏やかな日々。ある時、リックたちは食材探しに出掛けた森の奥で不思議な生き物と行き逢う。その小さな出来事は、やがて訪れる新たな出逢いと大いなる変化の予兆にすぎなかった──。

もうすぐ店じまいのル・クールに、黒くて小さな使い魔ソルベエが訪れる。その日から毎日、甘いパンを買いに来るソルベエに興味が湧き、三人娘はこっそりあとを尾けてみることに。たどり着いた先は島のはずれに建つ古びた洋館。その主、メルティは究極のスイーツを作ろうと研究を重ねる魔女だった。三人をすげなく追い返したものの、実はル・クールのパンに惹かれているメルティ。魔女と使い魔の、美味しさのヒミツ探しが始まる…。

ル・クールにウィンダリア城の侍女ローナが訪れる。ラグナス王子とルフィーナ王女から注文を言いつかってきたのだ。急いでパンを焼くリックたち。配達に向かったウィンダリア城にはなぜか、厳重な警備が。バラの園で出迎えたラグナスとルフィーナは、夜な夜な城に出没する盗賊の撃退をリックに依頼する。ネリス、ローナとともに城内を見回るリックの前に、ついに現れた盗賊、怪盗ブラックテール。激しい戦いを繰り広げた盗賊の正体は意外にも…？