第1話: メキシコのジャングルで発生した飛行機墜落事故から物語は始まる。現地当局によって回収され、検死所に運ばれた9体の遺体が横たわる場面から、このミステリーは幕を開ける。単なる事故ではなく、この9人がいかにして死に至ったのかが焦点となる。物語は、フラッシュバックや視点人物を次々に切り替える構成を通じて、墜落事故とその後の死に至るまでの出来事を再構築していく。過去の断片が繋がっていく中で、乗客たちの間に隠されていた繋がり、それぞれの動機、そして秘密が徐々に明らかになり、誰が殺人犯なのか、そしてなぜ犠牲者たちが標的になったのかという真相が解き明かされていく。 生存者たちは、ジャングルで一人、また一人と殺害されていく中で、互いに疑心暗鬼になる。

第2話: メキシコのモルグに運ばれた9体の遺体。ロペスは死体の顔とパスポート写真を照合する中で、一体の顔が剥がされていることに気づき、それが犯人特定の手がかりになると考える。物語は飛行機墜落事故から2日後の現場に戻る。オクタビオの死に心を痛めるケビンは、ザックと共に移動を決意する。生存者たちの間では緊張が高まり、互いに疑心暗鬼に陥っていく。オクタビオとトラビスの死は、特定の医学的症状を伴い、意図的な介入を示唆しているように見え、生存者たちは犯人やその動機を問い始める。オクタビオがガールフレンドのコーデリアに残した不気味なボイスメッセージは、彼らが生き残ることを許されず、誰かが危険に晒されていることを示唆し、パラノイアと陰謀の層を深める。各キャラクターの複雑な背景が明らかになるにつれて、物語はサバイバルから心理スリラーへと変貌し、最大の脅威は環境ではなく、閉じ込められた人々の中に潜んでいる可能性が示唆される。

第3話: 「ナイン・ボディーズ」第3話「ルチャドール」のあらすじは以下の通りです。 ロペスはベガに、カルロスのルチャドールとしての別名であるラピードが知事に敗れた過去の試合について語る。カルロスは携帯電話でその試合の映像を見ていたが、バッテリーが切れてしまう。また、カルロスが飛行機から食料を盗んでいたことが明らかになる。彼はELTに取り付けるアンテナを準備する。一方、ザックがコアティの肉を料理し、リサが昼寝をしている間に、エイミーは墜落現場を離れる。エイミーはダンとの関係に疑問を抱き、彼の過去を探るにつれて、ダンは攻撃的で防御的になる。エイミーはダンの連絡先カードに奇妙な点を見つけ、彼が何かを隠していると確信する。飛行機が麻薬を輸送していた可能性が示唆され、これが殺人の理由であると考えられる。

第4話: 謎のカウントダウンに悩まされ不眠に陥っていた汪淼（ワン・ミャオ）は、妻に「農場主と射手」の仮説について話す。彼は実験を中止することを決意するが、その際に誤ってパソコンを壊してしまう。その後、申玉菲（シェン・ユーフェイ）に電話をかけ、計時器の終わりについて問い詰めるが、彼女は彼の研究プロジェクトを一時中断すればカウントダウンは消えると告げる。実際にカウントダウンは彼の視界から消えるものの、パソコン画面には表示され続ける。警察の史強（シー・チアン）は、申玉菲が汪淼と会うのを目撃し、彼らを尾行する。汪淼は、自殺した天才物理学者・楊冬（ヤン・ドン）の母親である葉文潔（イエ・ウェンジエ）と接触する。そして申玉菲から「3日後、宇宙があなたのために瞬く」という信じがたい挑戦を突きつけられるのだった。

第5話: トマス・ウェイドは、マイク・エヴァンスの船「ジャッジメント・デイ」から三体人の機密情報を入手するため、ラージ海軍将校とオギーの協力を得て作戦を実行する。オギーはナノファイバー技術を再起動することに抵抗を感じるが、最終的に同意する。パナマ運河でナノファイバーが「ジャッジメント・デイ」を切り裂き、エヴァンスを含む乗船者全員が死亡する。クラレンスとウェイドはデータディスクを回収し、三体人が人類の嘘をつく能力に困惑している録音を入手する。この事実は葉文潔を動揺させる。ウェイドはジンに協力を求め、二人はVRヘッドセットを装着して三体人のアバターと対面し、三体人がソフォンを使って人類の科学の進歩を妨げようとしていることを知る。

第6話: メキシコのジャングルでの飛行機墜落事故の後、身元不明の9体の遺体を巡る調査に焦点が当てられる。クレア・サンディアタは夫ザックを探している。物語はコカイン密輸作戦を中心に展開し、ケビンが他の乗客に起こったことの主な責任者として浮上する。ケビンは墜落後、密輸計画の問題を防ぐためにパイロットのオクタビオから始め、他の生存者を次々と排除していった。彼は死体を使って麻薬を運び、コカインを遺体の中に隠し、軍が知らずに麻薬を運ぶことを計画していた。ケビンは救助活動中にベータブロッカーを使用して死んだふりをした。ザック・エリスは生き残り、ケビンの計画について検察官に情報を提供する。エピソードでは、ケビンとコラ（またはコーデリア）の複雑な関係が明らかになり、ケビンはオクタビオとの関係を知った後、コラをキノコで毒殺する。遺体の医学的検査では異常な状況が明らかになり、彼らの死の正確な状況について疑問が投げかけられる。モンテレイの病理学者が調査に派遣される。ケビンは逃走を試みるが、ザックは彼を捕らえることに失敗する。エピソードはケビンが逃げおおせたように見え、多くの疑問を残したまま終わる。