原作は『ハリケーン』というタイトルで、孤島に暮らす瀕死の老富豪を看病する若い妻とその秘書が、遺書を書きかえるまで、老富豪を延命させてくれとブラック・ジャックに依頼してくる、という物語でしたが、このアニメ版ではその老富豪がキマイラ病という謎の風土病に冒されていて、ブラック・ジャックは治療法不明のその奇病に立ち向かう、という物語になっています。これは原作マンガではブラック・ジャックと敵対しつづけるドクター・キリコがアフリカで謎の風土病に冒される、というエピソード『99.9パーセントの水』からの引用です。

原作マンガの『約束』というエピソードを元にオリジナルな物語が展開されていきます。原作マンガでは革命家の戦士が難民キャンプに匿われ、ブラック・ジャックはその機材も薬も何もないキャンプの中で革命家に応急処置を施し、いつか必ず完全な治療をしてやる、と約束する。という物語でした。今回のアニメ化では、その革命家を麻薬取引の容疑でユナイツ連邦に逮捕されたオルテガ共和国元首・クルーズ将軍、というふうに変更され、ブラック・ジャックは将軍奪還を目指すオルテガの部下たちとユナイツ連邦の特殊部隊との激しい銃撃戦の中で、将軍を末期癌から救うオペを敢行する、という物語となっています。

原作の『ふたりの黒い医者』と『あるスターの死』にインスパイヤされたオリジナル・ストーリーです。長い下積み時代を経てようやくスターの地位を手に入れたミシェルという女優が初主演映画の撮影中に倒れます。彼女は食べ物をいっさい受け付けない奇病に冒され、やせ細ってゆくのでした。ブラック・ジャックでも治療できないと知り、絶望した彼女は安楽死も医療の一つのあり方だと主張するドクター・キリコに出会い、そして…。という物語が展開されます。

原作にも『雪の夜ばなし』というタイトルのエピソードがありますが、それとは直接関係のないオリジナル・ストーリーが語られます。ブラック・ジャックのもとに二年も前に投函された手紙が届きます。読んでみるとそれには「妻の命が明日をも知れぬ状態です。助けてください」と綴られていました。ブラック・ジャックはその二年前の依頼人の下へと急ぎますが、彼を待ち受けていたのは鎌倉時代の武将の亡霊でした。さて、この奇怪な事件の真相は…。