ある日突然16cmになってしまった恋人・ちよみ (深田恭子) と、南くん (二宮和也) とのピュアで切ないラブストーリー。ちよみが直面する様々な危険と困難、小さくなった恋人の運命は…!?
エピソード1
彼女は身長16センチ
高校生カップルのちよみ (深田恭子) と南 (二宮和也) は、偶然訪れた中華料理店で未来が見えるという“フォーチュンクッキー”を食べ、不思議な予言を受ける。そんな中、駅伝部に所属する南は、高校最後の大会で選手に抜擢されるが、走っている途中に急激な腹痛に見舞われ…。
エピソード2
涙の電話
小さくなったちよみは、「こんな姿を祖父・千次 (北村総一朗) には見せられない」と言って家に戻らず、南の部屋で秘密の同棲を開始。南は、あれこれとちよみの世話を焼き、学校へも連れていくが、周囲からは挙動不審の目で見られる。迷惑を掛けていると感じたちよみは、南の元を飛び出すが…。
エピソード3
浮気発覚
成績がふるわない南 (二宮和也) は、追試をクリア出来ないと留年確定と宣告される。早速、勉強を始めようとする南だったが、同級生の麗花 (宮地真緒) の強引な誘いに押され、個人授業を受けることに。ちよみ (深田恭子) は、真剣に勉強する南の邪魔をしないよう陰から応援しようとするが…。
エピソード4
新婚初夜
南は夏恒例の家族旅行や駅伝部の合宿、友人とのキャンプなどを全て断って、ちよみと家に残り2人だけで過ごすことに。新婚のような気分に浸る2人だったが、それも束の間。「南がちよみをかくまっているのでは?」と疑う、麗花や担任の日下部 (田辺誠一) が次々にやって来て…。
エピソード5
浴衣で愛して…
体調を崩している千次 (北村総一朗) を安心させようと、電話で思わず「明日の夏祭りには帰る」と言ってしまったちよみ (深田恭子) は、南 (二宮和也) と相談してビデオメッセージを送ることに。翌日、ふたりはテープを届ける前に祭り見物に出掛けるが…。
エピソード6
海がくれたキス
ちよみは、千次のためにも早く元の姿に戻らなくてはという思いを強くする。いっぽう、南は麗花 (宮地真緒) から妊娠の相談を受けるが、結局それは思い過ごしと分かる。そんな中、改めて自分が南の負担になっていると感じたちよみは自立を決意し、最後の思い出に南を海へのデートに誘う。