ゴジゴジ島最大の危機に、ゴジラ三兄弟とゴジゴジ島の怪獣たちが挑む！ 宿敵キングギドラの時空を超えた戦い。10体以上の怪獣たちが協力して、『怪獣総進撃』さながらの大バトルが繰り広げられる。

幻の怪獣「バガン」が、待望の実写映像で登場！ 突然、天空がにわかに曇り、小美人ルネ＆ルナとルルベラの前に、バガンが出現。モスラVSバガンの因縁の戦いの序章がはじまる。

幼いラドンはミニラを母親のように慕っているが、やがて別れのときが訪れて…。「ミニラとラドン」の疑似親子ドラマのディレクターズカット版。