A.C.196年…地球国家軍と革命軍ホワイトファングの戦いが終結して1年。五飛を除き、平和な世界には必要なくなったガンダムを処分しようとするカトルたち。一方、地球ではレディ･アン指導のもと「プリベンター」が組織された。そんな時、リリーナがマリーメイアを元首とするマリーメイア軍に誘拐されてしまい…。

プリベンターとしてデキムの凶行を止めに入ったゼクスは、そこで真のオペレーション･メテオを知ってしまう。それはL3コロニー群のX18999を地球へ落とす作戦だったのだ。そんな中、廃棄したガンダム4機を回収したカトルは、ウイングガンダム0をヒイロに渡す。そして、ヒイロはウイングゼロで地球に向かい…。

マリーメイアとリリーナがいる基地のシェルターを破るため、フィルターの安全性を気にしながらも撃ち続けるヒイロ。ついにシェルターが破られ、その爆撃に巻き込まれたマリーメイアとリリーナを救ったのは、レディ･アンだった。マリーメイアが彼らの行動から真実を知った時、デキムがリリーナに銃口を向けて…。