其之一「巫女三姉妹見参」天津忠尋は、数年ぶりに広島県三次市と帰郷する。しかしそれは大きな禍の始まりだった。三次の地に足を踏み入れた忠尋を待っていたのは、怪しげな天狗面。天狗面は。忠尋を「審議者（さにわ）の血を継ぐ子」と呼び、左目に手をかけ…。其之二「入学式異変」三次市にある県立霞彩高校に入学した忠尋と柚子。二人を待っていたのは、三次駅で襲ってきた物の怪たちの仲間だった。学校に出現した異形の集団は、忠尋を狙い追いかけてくる。柚子は忠尋を守るべく巫術を駆使し、これに対抗するのだが…。

其之三「巫女委員会設立」度重なる物の怪の襲来に、霞彩高校の教師である倉子は、一つの提案をする。学校の秩序を守るため、妖怪調伏を目的とした巫女委員会を設立するというのだ。実践経験のある柚子は、当然として、他の委員は…？ 果たして集まるのか？其之四「巫女委員募集中」柚子と親友の力石征子、百合草千佳が巫女委員となったものの、それ以降まったく立候補のいない委員会。そこに酔狂な人間が現れた。オカルト大好き、岬原いずみである。いずみはいくつかの不純な動機により、巫女委員会になることを決意する。

其之五「集結巫女委員会」最後の巫女委員が見つかった。超ブルジョワなお嬢さまの御堂志津歌である。そこに、物の怪が出現！ いきなり、初出撃を余儀なくされる巫女委員会。しかも、頼みの綱の柚子がいない。新人巫女の四人に危機が迫る!!其之六「巫女大修行」巫女委員会の本格的な活動が開始された。まず委員会メンバーに科せられたのは、巫女としての修行だった。新人巫女の四人は倉子の厳しい修行に疲労困憊、満身創痍。そんなみんなを見て、勧誘した柚子は責任を感じ、落ち込んでしまう…。

其之七「巫術開眼」一通りの修行を終えた四人の新人巫女たちに手渡された神器。しかし彼女たちは、神器を使いこなせないでいた。そんな時、柚子が物の怪の手に落ちてしまう。仲間の危機に巫女委員たちは…。其之八「ヤガレナ」柚子が襲われたのは自分のせいだと気に病む忠尋に倉子は稲生神社に伝わる一冊の古文書を見せる。そこには神の名が記されていた。その神こそ、乱裁道宗の目的。委員会の本当の的だった。

其之九「怪猫疾風」またしても忠尋の目の前に現れた物の怪たち。手強い物の怪に柚子を欠いた巫女委員会は苦しい戦いを強いられる。そこに現れた二匹の黒猫。それは人へと姿を変え、巫女委員会の窮地を救う。其之拾「巫女大合宿」夏休みに入り、浮かれる巫女委員会たちは合宿と称して志津歌の別荘へと旅立つ。そう、忠尋と直範（三姉妹の父）を稲生神社に残して…。男二人はさておき、柚子、征子、千佳、いずみ、志津歌は夏を満喫！

其之拾壱「灼熱恋愛指南」なかなか進展しない忠尋と柚子の仲を心配した巫女委員の面々は、夏の思い出を作らんがため、柚子に恋愛指南を開始する。しかし、あまりに適切とはいえない指南に怒りを感じた柚子は四人に恐怖のお仕置きを！其之拾弐「騒乱祭囃子」チームワークの欠片も見られない夏の強化合宿終了間際、倉子はみんなを夏祭りへと連れ出す。息抜き兼チームワーク育成のためである。しかし五人は祭り会場でもケンカを始めてしまう…。