人生どん底のダメフリーターの花垣武道（タケミチ）は、中学時代に付き合っていた人生唯一の恋人橘日向（ヒナタ）が犯罪組織“東京卍會”の抗争に巻き込まれて死亡したことを知る。突然の悲報に驚きながらも変わらぬ日常を過ごすタケミチだったが、駅のホームで何者かに突き飛ばされて線路へ転落。迫り来る電車に死を覚悟したが、目を開けると何故か12年前にタイムリープしていたのだ。

12年前、東京卍會で“マイキー派”と“ドラケン派”に分かれての内部抗争が起こり、ドラケンが死亡したことを知ったナオト。ナオトからの報告を聞いても、マイキーとドラケンが争うことなどあり得ないと信じるタケミチは、抗争の真の原因を探り、ドラケンを救うため、再び過去へと戻る。決意を新たにタイムリープしたタケミチだが、目を開けるとそこには下着姿の見知らぬ少女がいて…。

東京卍會参番隊隊長・林田春樹（パーちん）の親友が襲われたことをきっかけに、東京卍會と、新宿を仕切っている愛美愛主（メビウス）の抗争が始まろうとしていた。ナオトによると、ドラケンが死亡するのは愛美愛主（メビウス）との抗争ではなく、東京卍會の内部抗争が原因のはずだが…。その日、本当は何が起きるのか。愛美愛主の総長・長内信高から真実を聞き出すため、タケミチは現代に戻る。